با حكم رئيس شوراي عالي و رئيس مركز، حجت الاسلام دكتر حميدپارسانيا عضو حقيقي شوراي عالي انقلاب فرهنگي به سمت رئيس انديشكده مباني، دكتر غلامعلي افروز استاد نمونه كشوري به سمت رئيس انديشكده خانواده و حجت الاسلام والمسلمين عليدوست محقق و مولف حوزه علميه قم و مدرس پرسابقه درس خارج فقه به عنوان رئيس انديشكده فقه و حقوق اسلامي و دكتر پناهي استاد دانشگاه علامه طباطبايي و رئيس كرسي نظريه‌پردازي جامعه‌شناسي به سمت رئيس انديشكده امور اجتماعي، جمعيت و نيروي انساني تعيين شدند. يادآور مي‌شود قبل از اين حجت‌الاسلام دكتر ميرمعزي و دكتر جبل عاملي از اعضاي شوراي عالي مركز به ترتيب به عنوان رؤساي انديشكده عدالت و انديشكده آمايش بنيادين تعيين شده بودند. انديشكده‌هاي الگو، اتاق‌هاي فكري متشكل از صاحب‌نظران برجسته كشور از ميان اساتيد صاحب كرسي دانشگاه و حوزه، مديران راهبردي كشور و تني چند از محققان برگزيده جوان هستند و وظيفه تدوين روش‌شناسي و مباني مرتبط با عنوان انديشكده، تحليل انتقادي نظرات توسعه و كمك به نظريه‌پردازي در زمينه پيشرفت اسلامي ايراني و تدوين الگوي متناسب با آن، با استفاده از ظرفيت گسترده تخصصي كشور، پيشنهاد محورهاي تحقيقاتي و ارائه آن به مراكز علمي و همچنين ارزيابي و آسيب‌شناسي روند گذشته و وضعيت فعلي امور مهم كشور در حوزه مربوط را بر عهده دارند.